現代藥理研究表明，黃連含有小櫱鹼、黃連鹼、甲黃連鹼及棕櫚鹼等化學成分，具有較強的抗菌作用，同時還有降血壓、擴張血管、降血糖、利膽、解熱、抗炎、強心、促進組織癒合、利尿、鎮痛、鎮靜、降低眼內壓、抗癌等作用。
黃連是以「苦」著稱的中藥，性寒，味苦，傳統上多用於腸胃濕熱所致的腹瀉、痢疾、嘔吐、熱盛火熾、煩躁、癰腫瘡毒等症。現代藥理研究表明，黃連含有小櫱鹼、黃連鹼、甲黃連鹼及棕櫚鹼等化學成分，具有較強的抗菌作用，同時還有降血壓、擴張血管、降血糖、利膽、解熱、抗炎、強心、促進組織癒合、利尿、鎮痛、鎮靜、降低眼內壓、抗癌等作用。
治療高血壓 每天0.75～4克，分3～4次口服，6～14天為1療程。黃連中的黃連鹼具很廣的抗菌譜，能抑制鏈球菌，又能擴張血管。若用於腎炎高血壓及高血壓伴心絞痛的患者，能夠收到雙重效果。
治療心律失常 每天4次，每次口服0.4克。顯效後逐漸減至維持量：若服藥5～7天仍無效或未有顯效者，則加量至0.5～0.6克，每日4次，2～4周為1個療程。
治療2型糖尿病 每日口服黃連素片3次，每次0.3～0.5克。
治療萎縮性胃炎黃連500克，食醋500毫升（以瓶裝醋為優），白糖500克，山楂片1000克，加開水4000毫升，混合浸泡7日便可服用；每日3次，每次50毫升，飯後服。連續服用90～150天見效。
治療潰瘍性結腸炎 其一是將黃連粉在乙狀結腸鏡窺視下，直接噴到潰瘍或病變部位，每次用藥1.8～2.4克，隔日1次，9次為1療程。二是把生黃連粉混於150毫升溫水中灌入腸中，隔日灌1次，9次為1療程。開始使用時偶有痛感，經2～3次後即可消失。
治療白喉 每次口服黃連粉0.6克，每日4～6次，並配合1%的黃連溶液漱口。用藥後體溫在1～3天內能恢復正常，假膜平均2.6天消退，咽拭培養平均2.8天轉陰。
治療腳濕氣黃連10克打碎，以開水250毫升浸泡，冷卻後洗淨患腳，亦可用棉簽蘸浸泡搽之，每天早晚各1次。如有劇癢，可用棉簽浸泡擦洗，但不可用手抓搔。用藥期間需保持患處乾燥清潔，不可穿膠質鞋。一般5～12天便能痊癒。
治療麥粒腫 黃連15克打碎，放入瓶內，然後把乳汁擠入，以浸沒藥物為度，浸泡1天，濾出乳汁，點塗患處，每天3～4次。一般用藥後次日紅腫漸消，疼痛減輕；3天後紅腫全消而痊癒。
如果看到這裡還沒有解决問題，請繼續往下看：
黃連治療濕熱痢疾!
黃連，性苦寒，歸心肝胃大腸經，可以清熱燥濕，瀉火解毒，在清熱燥濕方面，在中焦方面有很好的療效，重點在胃腸，常用於治療大腸濕熱，濕熱痢疾。
黃連，它重點也是除了廣泛可以用於比如剛才的淋證，濕溫病也有用黃連的，濕溫、暑濕，淋證，黃疸等等濕熱瘡疹都能用。但是它的重點在胃腸，尤其是大腸濕熱，大腸濕熱最常見的就是濕熱痢疾。所以黃連是中醫治療濕熱痢疾的最重要的一個藥物，或者說是一個首選的藥物。
《神農本草經》所載的藥物歷用不衰，用之有驗，就舉了黃連之例，就是治療的痢疾。中醫對痢疾的認識它既可以稱為濕熱痢疾，也可以稱為熱毒痢疾，因為痢疾本身它屬於熱毒證，有的還有比較明顯的相互傳染的情況。比如疫毒痢，症狀還重，所以有時候還叫做熱毒痢。但是痢疾的排泄物穢臭，符合中醫濕熱致病的（特點），所以把它叫做濕熱痢疾。所以這兩種稱呼實際上都可以，只是從不同的角度來談它的病因。黃連呢，清熱燥濕，清熱解毒的作用對於痢疾都相當好，所以一直從《神農本草經》開始，治療痢疾，黃連就是經常選用的，或者首先選用的一個藥。
最簡單的就是香連丸，黃連和木香。因為痢疾有里急後重，里急後重呢，就是想排便又不通暢，一種很難受的下墜的緊迫感。至於治療這個呢，主要是大腸的氣滯，加一點木香呢，行氣導滯，有利於緩解里急後重的症狀。那麼痢疾呢，有便下膿血，便下膿血就有瘀滯，有時候還可以加一點活血化瘀、活血止痛的藥。所以前人說治療痢疾行氣則後重除，活血則膿便愈。也就是說以黃連這一類藥為主的同時，可以適當的少量的配伍一點行氣活血的藥物來使用。所以黃連在眾多的濕熱病證當中，它特徵最顯著的就是濕熱痢疾多選用。當然如果是胃脘有濕熱引起的痞滿，黃連也比其他兩味藥用得多一些。就是它重點在胃腸，尤其是大腸為主。
黃連配阿膠可滋陰潤肺除煩安眠
黃連配吳茱萸
吳茱萸味辛苦而性大熱，有小毒。入肝、腎、脾胃經。可溫中止痛，降逆止嘔，殺蟲。吳茱萸善解 肝經郁滯而能行氣止痛，以止痛止嘔之功為佳。溫中散寒，功類乾薑。吳茱萸為肝經主藥，性雖大熱，但在肝鬱氣滯時，如有熱象，亦可與寒涼藥同用，如左金丸。 左金丸由黃連、吳茱萸組成，出自《丹溪心法》。方以黃連瀉心火，使火不克金，金能制木，肝火自平；吳茱萸辛熱入肝，行氣解郁，引熱下行。二藥為伍，一寒一 熱，寒為正治，熱為從治。主治肝膽鬱火之脅痛，嘔吐，吞酸，燒心等病症。常用量原方黃連與吳茱萸之比為6：1。目前均用1.5～6克。因系寒熱並用，寒重 加重吳茱萸用量，熱盛加重黃連用量。
黃連配阿膠
阿膠味甘，性平。入肺、肝、腎經。可補血止血，滋陰潤肺。黃連瀉心 火，除煩熱；阿膠補陰血而潤燥，既能滋腎水，又可補心血。二藥為伍，清補合用，使腎水得養而能上濟於心，心火得清，心神自安。屬補腎水、瀉心火之法。對陰 虛火旺之虛煩不得眠最為適宜，也用於熱病傷陰之虛煩不眠等病症。常用量黃連1.5～6克，阿膠9～15克。阿膠應另行烊化，沖入藥汁中內服。
葛根黃芩黃連湯
葛根黃芩黃連湯，簡稱為葛根芩連湯。它是治療急性腹瀉的經典名方，其卓越的清熱止瀉功效，不僅受到歷代醫家的普遍重視，也為現代臨床廣泛應用，現已被製成多種劑型的中成藥，療效可靠，應用方便。
黃芩、黃連、黃柏有何區別
黃芩善於治療肺熱咳嗽、高熱驚風、吐血鼻衄、頭痛鼻淵等症、如配知母、桑白皮、荷葉、銀花、連翹、桔梗、桔仁等治療肺熱咳嗽痰多等症。