只有陰陽雙方維持著動態平衡狀態，才能使人的精神活動正常，所謂「陰平陽秘，精神乃治」。所以陰陽與睡眠息息相關，滲透到中醫理論的各個方面。人體陰陽消長的變化，決定了睡眠和覺醒的生理活動。自然界的陰陽變化，有其節律，人體陰陽消長與其相應，也有明顯的節律。天地陰陽的盛衰消長，致使一天有晝夜晨昏的節律變化。醫學`教育網搜集整理人與自然界是統一的整體，人體的陽氣，隨氣有消長出入的日節律運動。平旦時人體的陽氣隨自然界陰氣生發而由里出外，陽氣漸長，人起床活動，中午時分人體陽氣盛於外部，黃昏則陽氣漸消，入夜則陽氣潛藏於內，人上床休息。陽入於陰則寐，陽出於陰則寤。陰主靜，陽主動；陽氣衰，陰氣盛，則睡眠；陽氣盛，陰氣衰，則產生覺醒。這種陰陽盛衰主導睡眠和覺醒的機制，是由於人體陽氣入里出表的運動來決定的。在正常情況下，人的陰陽調和，血脈通利，故晝精而夜寐，夜晚有充足高質量的睡眠，體力和精力得以恢復，白天精力充沛，思維敏捷。
科學研究也提供了人體的陰陽日節律的相關論證，以內分泌來說，即表現出陰陽日節律的變化，如人體甲狀腺素、促腎上腺皮質激素、糖皮質激素、腎素、醛固酮、促性腺激素、睪酮等等白天分泌增加，夜間分泌降低；而甲狀旁腺素、腎上腺皮質激素、生長激素、血管升壓素等夜間分泌增加，白天分泌下降。
現代睡眠學認為，睡眠與覺醒系統作用下，要使睡眠得以發生，力量相對較強的覺醒系統的活動應首先減弱，力量相對較弱的睡眠系統充分發揮作用，以致進入睡眠。覺醒系統活動過強，或睡眠系統力量不足，則不能發生睡眠。覺醒系統活動增加，睡眠系統用作減弱，人就覺醒了。這種理論，與陰陽睡眠學說如出一轍，覺醒系統比類為陽，睡眠系統比類為陰，陰陽相互矛盾，相互鬥爭，又相互依存，相互協調，共同來完成睡眠與覺醒的生理活動，這與陰陽理論異曲同工。可以說陰陽失調是睡眠障礙發病的重要病機。
總之，陰陽學說解釋了中醫睡眠的生理與病理，指導著中醫對失眠的診斷、治療和調養健康
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