咳嗽是常見的外感疾病症狀之一，在許多呼吸系統疾病中最常見，如流感、支氣管炎、肺炎、哮喘等。引起咳嗽的病因，除了上述呼吸系統疾病以外，還有諸多疾患也可引起咳嗽。
喉部疾病：如聲帶炎，慢性咽喉炎，多引起聲音沙啞性咳嗽；犬吠樣咳嗽多見於聲帶水腫、氣管異物。
流行性感冒：咳嗽伴有打噴嚏、流清涕，常見於普通感冒。若伴有高燒，很可能是流感，特別是發生於冬春季的咳嗽並伴有發高燒、肩背痛，流感可能性最大。
胃酸反流病：由胃酸反流刺激食管引起的咳嗽約占全部慢性咳嗽病人的20%，病人除咳嗽外，還常伴有發燒、吐酸水、打嗝、胸骨後疼痛等症狀。
心源性咳嗽：心臟病人出現心功能不全時，最初常有慢性持續咳嗽，平臥位或勞累時加劇，同時伴有胸悶、呼吸困難，嚴重時咯粉紅色泡沫痰，被迫端坐呼吸。體檢在兩肺底可聞及密集濕性羅音。
慢性鼻竇炎：患者由於鼻分泌物增多，向後倒流到咽喉部黏膜上，因而刺激咳嗽。病人有明顯的咽部異物感且屢咳不爽，仰臥位或清晨起床加劇。此外，常感到頭痛，大量流清涕或濃涕。檢查時發現病人口咽有黏液或膿性分泌物，咽後壁欠光滑呈鵝卵石樣改變，鼻竇區伴有明顯壓痛。
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單聲的輕咳：多見於咽喉炎、氣管炎及早期肺結核。陣發性痙攣性咳嗽常見於百日咳、氣管炎、支氣管哮喘。5歲以內小兒陣發性咳嗽，劇咳後有雞鳴樣聲音，咳時面紅、嘔吐、氣喘、不能平臥，並咯出大量白色黏液痰者，見於支氣管哮喘。
腫瘤：不僅肺本身會長原發瘤，而且各部位的腫瘤一旦發生細胞脫落，就會游離到肺部引起咳嗽。因此，很多不容易發現的腫瘤，往往是肺部發現了轉移灶後，才被證實。
心理因素：精神因素也可以引起咳嗽，往往在精神緊張、情緒波動時出現，受暗示影響大，睡覺後不咳嗽，對睡眠無影響。通過心理治療，改變心態，病人症狀可望好轉或痊癒。
此外，咳嗽伴有咽喉痛，常見於急性咽炎、扁桃體炎。咳嗽伴有胸痛，可能是肺炎、胸膜炎。咳嗽並咯血，可能是支氣管擴張或空洞性肺結核。咳嗽、胸痛、高熱、咯鐵鏽痰者，可見於大葉性肺炎。夜間陣發性咳嗽，多見於心力衰竭等。
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